本题考查的是中药材的品种与栽培。

A选项：柴胡来源为伞形科植物柴胡或狭叶柴胡的干燥根，其来源共2个种类。

B选项：大黄来源为蓼科植物掌叶大黄、唐古特大黄或药用大黄的干燥根及根茎，其来源共3个种类。

C选项：甘草来源为豆科植物甘草、胀果甘草或光果甘草的干燥根及根茎，其来源共3个种类。

D选项：秦艽来源为龙胆科植物秦艽、麻花秦艽、粗茎秦艽或小秦艽的干燥根，其来源共4个种类。

E选项：川贝母来源为百合科植物川贝母、暗紫贝母、甘肃贝母、梭砂贝母、太白贝母或瓦布贝母的干燥鳞茎，其来源共6个种类。

综上所示，来源种类为3个种及以上的是大黄、甘草、秦艽、川贝母。