增值税小规模纳税人只需在“应交税费”科目下设置“应交增值税”明细科目，不需要设置除“转让金融商品应交增值税”“代扣代交增值税”外的明细科目。因此抵减增值税及缴纳增值税，均借记“应交税费—应交增值税”。

初次购买增值税税控系统专用设备支付的费用，按实际支付或应付的金额，借记“固定资产”科目，贷记“银行存款”、“应付账款”等科目。按规定抵减的增值税应纳税额，借记““应交税费——应交增值税（减免税款）”科目（小规模纳税人借记“应交税费——应交增值税”科目），贷记“管理费用”等科目。