(1)不妥之一：招标文件对于本地区投标单位与外地区投标单位制定不同的规则； 理由：不符合招投标法的公正、公平原则。
不妥之二：当地建设行政主管部门指定丙公司作为招标人指定招标代理机构； 理由：应由招标人自行组织或委托具备相应资格的单位进行招标，不能由行政主管部门指定。
不妥之三：负责组织召开并主持招标预备会议与开标会议； 理由：组织并主持招标预备会议和开标会，应由招标单位或其代理公司负责主持，接受当地建设行政主管部门招投标相关管理部门监督。
不妥之四：招标人拒绝乙公司的新报价方案； 理由：在开标前投标人提交的新文件应属于招标文件的有效补充文件。

(2)选用总价合同模式不妥当； 理由：施工图设计未完成，虽然工程性质已明确，但工程量还难以确定，工程价格随工程量的变化而变化，双方风险都比较大，不适宜采用总价合同模式。

(3)不妥之一：甲方向乙方提供现场的工程地质与地下主要管网资料，仅供乙方参考使用，甲方不对由此带来的费用及工期负责； 正确做法：甲方应对提供的资料（数据）真实、准确性负责，并作为乙方现场施工的依据。现场如与提供资料不符，甲方对工期及费用负责。
不妥之二：允许分包单位将分包的工程再次分包给其他施工单位； 理由：分包单位再次分包属于违法分包。

(4)事件一：施工单位做法不合理； 理由：施工单位有保证施工现场安全状况的义务，与是否检查无关。 事件二：施工单位做法不合理； 理由：建设单位只是推荐，并不是建设单位采购，不承担责任。